تناولت قصة الفلم هذه المرة مهمة أعادة شخص يدعى موكاد وهو يحاول تنفيذ تقنية محرمة ، تعود به إلى الوراء وأثناء ذلك يتم تحريك هذه القوة الغريبة فتحيط ناروتو بضوء وعندما أنقشع الضوء ود نفسه رجع بالزمن 20 سنة ،، ومن ثم سيقابل والده ، ومن ثم تبدأ المغامرة الرائعة.